La pandemia producida por el virus influenza A(H1N1)pdm09 en Cuba se calificó de leve a moderada por su impacto. Sin embargo, entre los meses de abril a diciembre del año 2009 se produjo un incremento en las notificaciones de infección respiratoria aguda grave (IRAG) y los casos fatales. El presente estudio tuvo como objetivo determinar la relación de los niveles de expresión del ARN de IL-1β, IL-8, RANTES y el TLR-2, y la presencia del CCR5Δ32 con la severidad de la enfermedad producida por los virus influenza A(H1N1)pdm09 en Cuba. Se realizó un estudio descriptivo de casos donde se incluyeron 76 muestras provenientes de pacientes que padecieron enfermedad tipo influenza (ETI), IRAG o que fallecieron. Se realizó la cuantificación relativa del ARN de IL-1β, IL-8, RANTES y el TLR-2, y la detección del CCR5Δ32. Los análisis estadísticos se realizaron con los programas IBM SPSS Statistics v.19 y GraphPad Prism v.5. Los resultados obtenidos demostraron que RANTES (p=0.0002) y el TLR-2 (p=0.0011) contribuyeron significativamente al incremento de la severidad del cuadro clínico producido por el virus pandémico. Otro hallazgo fue que se encontró una relación significativa (p=0.0013) entre la deleción 32 del CCR5 y el fallecimiento de personas con diagnóstico positivo a influenza A(H1N1)pdm09. Los resultados aquí expuestos aportan conocimientos que permitirán ampliar el espectro de intervenciones sobre la interacción virus-hospedero, con el objetivo de disminuir las complicaciones de la enfermedad. Sin embargo, constituye un gran reto realizar estas intervenciones con elevado grado de precisión para equilibrar los efectos positivos y negativos del sistema inmune.